Un asunto pendiente que han arrastrado las legislaturas locales desde lo administrativo han sido los juicios laborales en los que se encuentra envuelto el Congreso local del Estado de Jalisco.
Al inicio de este año un informe de la Comisión de Administración sobre la entrega-recepción de este poder local reveló que la legislatura entrante enfrentaría 408 juicios laborales ante el Tribunal de Arbitraje y Escalafón del Estado, al 8 de noviembre de 2015.