Durante la última administración la Comisión Estatal de Derechos Humanos de Jalisco (CEDHJ) ha sido señalada por organizaciones civiles por su aparente omisión ante las violaciones a los derechos de la población.
Las declaraciones de las organizaciones tomaron fuerza durante este año y detallan que, contrario a la postura de la Comisión Nacional de Derechos Humanos (CNDH) en temas como el matrimonio igualitario en Jalisco, el organismo local sólo se ciñe a las declaraciones del gobierno en turno.